Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPTFQ12830 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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