Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 SEC17YBL050W 879 nt5.27□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 UTP18YJL069C 1785 nt5.27□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 HFI1YPL254W 1467 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 RIM101YHL027W 1878 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 PDH1YPR002W 1551 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 HEM3YDL205C 984 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YGR176WYGR176W 348 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YKL223WYKL223W 333 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 HOR7YMR251W-A 180 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 LST8YNL006W 912 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 PGA2YNL149C 390 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 HXT3YDR345C 1704 nt5.26□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 ARO10YDR380W 1908 nt5.25□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YNR048WYNR048W 1182 nt5.25□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 MCM6YGL201C 3054 nt5.25□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 TEF1YPR080W 1377 nt5.25□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 TEF2YBR118W 1377 nt5.25□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 IES1YFL013C 2079 nt5.25□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 VPS1YKR001C 2115 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 ODC2YOR222W 924 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YTH1YPR107C 627 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 PDB1YBR221C 1101 nt5.24□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 RBA50YDR527W 1320 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 MKK2YPL140C 1521 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 OXP1YKL215C 3861 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 MTQ2YDR140W 666 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YDR541CYDR541C 1035 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YKL031WYKL031W 414 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 ARR3YPR201W 1215 nt5.23□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 RHO3YIL118W 696 nt5.22□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 HSP104YLL026W 2727 nt5.22□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YEL077CYEL077C 3834 nt5.22□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 RPT1YKL145W 1404 nt5.22□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 HOS1YPR068C 1413 nt5.22□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 EIS1YMR031C 2532 nt5.22□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 DED81YHR019C 1665 nt5.21□□□□□ -1.57
SNF8Q12483 YIR007WYIR007W 2295 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YDR053WYDR053W 396 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 GLO2YDR272W 825 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 CDC43YGL155W 1131 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 ORM1YGR038W 669 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 JJJ3YJR097W 519 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YKR073CYKR073C 321 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 SEN34YAR008W 828 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 PIN2YOR104W 849 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 UBC4YBR082C 447 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 ROG3YFR022W 2202 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 CST6YIL036W 1764 nt5.21□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 PPR1YLR014C 2715 nt5.2□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 FOB1YDR110W 1701 nt5.2□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 NOP2YNL061W 1857 nt5.2□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 COX26YDR119W-A 201 nt5.19□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 CWC21YDR482C 408 nt5.19□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 MND2YIR025W 1107 nt5.19□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 ENV9YOR246C 993 nt5.19□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 RPT4YOR259C 1314 nt5.19□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 HRP1YOL123W 1605 nt5.19□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 GEP3YOR205C 1671 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 HPF1YOL155C 2904 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YDL034WYDL034W 345 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YGR022CYGR022C 330 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 DOM34YNL001W 1161 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YPR195CYPR195C 330 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 PDC1YLR044C 1692 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 SNT2YGL131C 4212 nt5.18□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 SMF3YLR034C 1422 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 MSS116YDR194C 1995 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 ARP1YHR129C 1155 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 PUS5YLR165C 765 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 SSP120YLR250W 705 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 MRPL22YNL177C 930 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 PDR16YNL231C 1056 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YNL247WYNL247W 2304 nt5.17□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 AIM17YHL021C 1398 nt5.16□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 VMA16YHR026W 642 nt5.16□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 MRP17YKL003C 396 nt5.16□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 NRM1YNR009W 750 nt5.16□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 MRPL36YBR122C 534 nt5.16□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 VAN1YML115C 1608 nt5.15□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 BUD14YAR014C 2130 nt5.15□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 MKC7YDR144C 1791 nt5.15□□□□□ -1.58
SNF8Q12483 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.15□□□□□ -1.59
SNF8Q12483 GCS1YDL226C 1059 nt5.15□□□□□ -1.59
SNF8Q12483 FHN1YGR131W 525 nt5.15□□□□□ -1.59
SNF8Q12483 CBP4YGR174C 513 nt5.15□□□□□ -1.59
SNF8Q12483 COS9YKL219W 1224 nt5.15□□□□□ -1.59
SNF8Q12483 DCN1YLR128W 810 nt5.15□□□□□ -1.59
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