Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 APN1YKL114C 1104 nt5.63□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 DOM34YNL001W 1161 nt5.63□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 POR1YNL055C 852 nt5.63□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 TRK2YKR050W 2670 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 CWC21YDR482C 408 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 YGR022CYGR022C 330 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 HCR1YLR192C 798 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 TRP3YKL211C 1455 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 UGO1YDR470C 1509 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 RIM101YHL027W 1878 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MSS116YDR194C 1995 nt5.62□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 SYF2YGR129W 648 nt5.61□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 PPR1YLR014C 2715 nt5.61□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 PIF1YML061C 2580 nt5.61□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 YNL247WYNL247W 2304 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MET7YOR241W 1647 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MTF2YDL044C 1323 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MRP17YKL003C 396 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 RHO4YKR055W 876 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 PGA3YML125C 939 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 RPS15YOL040C 429 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 SCT1YBL011W 2280 nt5.6□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 VAM7YGL212W 951 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 RPR2YIR015W 435 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 RHO2YNL090W 579 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MRPL36YBR122C 534 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 RRT2YBR246W 1164 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 ACF2YLR144C 2340 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 SHE10YGL228W 1734 nt5.59□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 ALT1YLR089C 1779 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 DBP9YLR276C 1785 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 NSI1YDR026C 1713 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 SFC1YJR095W 969 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 PIN2YOR104W 849 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 PEX32YBR168W 1242 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 UTP7YER082C 1665 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 CDC19YAL038W 1503 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 BAP2YBR068C 1830 nt5.58□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YIR007WYIR007W 2295 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YDL172CYDL172C 480 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 COX26YDR119W-A 201 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 ERP5YHR110W 639 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 DCN1YLR128W 810 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YML131WYML131W 1098 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 PAP1YKR002W 1707 nt5.57□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 ECM7YLR443W 1347 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 VCX1YDL128W 1236 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 PSH1YOL054W 1221 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YPR098CYPR098C 486 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YFL034WYFL034W 3222 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 RNR3YIL066C 2610 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 SEC12YNR026C 1416 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 RFA1YAR007C 1866 nt5.56□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 CSL4YNL232W 879 nt5.55□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YNR048WYNR048W 1182 nt5.55□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 NOP7YGR103W 1818 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YGR176WYGR176W 348 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YIL060WYIL060W 435 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YJU2YKL095W 837 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 TFS1YLR178C 660 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 CPA1YOR303W 1236 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 FLC3YGL139W 2409 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 BPL1YDL141W 2073 nt5.54□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 CLP1YOR250C 1338 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 MTQ1YNL063W 945 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 RPT1YKL145W 1404 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 TEF1YPR080W 1377 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 TEF2YBR118W 1377 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 CTS2YDR371W 1536 nt5.53□□□□□ -1.52
LDB17Q12342 MTC2YKL098W 1074 nt5.52□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 DAL82YNL314W 768 nt5.52□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 UBC4YBR082C 447 nt5.52□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 VTC2YFL004W 2487 nt5.52□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 UTP18YJL069C 1785 nt5.52□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 VBA1YMR088C 1689 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 YDL034WYDL034W 345 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 YDR541CYDR541C 1035 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 EFM4YIL064W 774 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 COS9YKL219W 1224 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 YLR296WYLR296W 327 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 HOR7YMR251W-A 180 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.51□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 GEP3YOR205C 1671 nt5.5□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 VAN1YML115C 1608 nt5.5□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 HEM3YDL205C 984 nt5.5□□□□□ -1.53
LDB17Q12342 DON1YDR273W 1098 nt5.5□□□□□ -1.53
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