Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM1Q08AH1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACSM1Q08AH1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACSM1Q08AH1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms