Protein–RNA interactions for Protein: Q04603

DPB4, DNA polymerase epsilon subunit D, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB4Q04603 ACS2YLR153C 2052 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 GPD2YOL059W 1323 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 UBP7YIL156W 3216 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 YDR541CYDR541C 1035 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 GLE2YER107C 1098 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 YLR296WYLR296W 327 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 MAC1YMR021C 1254 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 YPL014WYPL014W 1146 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 PTC4YBR125C 1182 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 PCL8YPL219W 1479 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 ADE13YLR359W 1449 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 WTM2YOR229W 1404 nt5.3□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 OXP1YKL215C 3861 nt5.29□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 MDH3YDL078C 1032 nt5.29□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 MRL1YPR079W 1146 nt5.29□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 TUP1YCR084C 2142 nt5.29□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 MRE11YMR224C 2079 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 LAP2YNL045W 2016 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 YGR122WYGR122W 1209 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 YKR045CYKR045C 552 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 TSR2YLR435W 618 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 TOM40YMR203W 1164 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 SMA1YPL027W 738 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 RPL21AYBR191W 483 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 PTC3YBL056W 1407 nt5.28□□□□□ -1.56
DPB4Q04603 TAX4YJL083W 1815 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 SAP155YFR040W 3009 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 RPL7AYGL076C 735 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 SKI8YGL213C 1194 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 KSS1YGR040W 1107 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 RIM101YHL027W 1878 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 PWP1YLR196W 1731 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 FPR3YML074C 1236 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 RPL7BYPL198W 735 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 CTR1YPR124W 1221 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 ILV6YCL009C 930 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 HER2YMR293C 1395 nt5.27□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 UIP5YKR044W 1332 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 ISR1YPR106W 1332 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 MRPL4YLR439W 960 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YMC1YPR058W 924 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 SDA1YGR245C 2304 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 MET3YJR010W 1536 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 ZWF1YNL241C 1518 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YIL067CYIL067C 2037 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 MBP1YDL056W 2502 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 ARN1YHL040C 1884 nt5.26□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 VHS2YIL135C 1311 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 EXG1YLR300W 1347 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 DHH1YDL160C 1521 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 IMG1YCR046C 510 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YDR278CYDR278C 318 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 COA1YIL157C 594 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 PHO86YJL117W 936 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YJR084WYJR084W 1272 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 GTR1YML121W 933 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YOR292CYOR292C 930 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 VHS1YDR247W 1386 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 KEX2YNL238W 2445 nt5.25□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 AMD2YDR242W 1650 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 SUM1YDR310C 3189 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 FPK1YNR047W 2682 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 CBP1YJL209W 1965 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 GIP2YER054C 1647 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YJL193WYJL193W 1209 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 SGF29YCL010C 780 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 SEC39YLR440C 2130 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 HPC2YBR215W 1878 nt5.24□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YAP1801YHR161C 1914 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YDL121CYDL121C 450 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 RTN1YDR233C 888 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 IRC7YFR055W 1023 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YGL185CYGL185C 1140 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 DBR1YKL149C 1218 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 PPA2YMR267W 933 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 NCE103YNL036W 666 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 RPS3YNL178W 723 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 MST1YKL194C 1389 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 KRS1YDR037W 1776 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 EPS1YIL005W 2106 nt5.23□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 IML2YJL082W 2196 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 HRQ1YDR291W 3234 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 CTF18YMR078C 2226 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 BUG1YDL099W 1026 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YGP1YNL160W 1065 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 NOP13YNL175C 1212 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 PRP24YMR268C 1335 nt5.22□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 GSY2YLR258W 2118 nt5.21□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 YLL067CYLL067C 3618 nt5.21□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 ATH1YPR026W 3636 nt5.21□□□□□ -1.57
DPB4Q04603 PRP46YPL151C 1356 nt5.21□□□□□ -1.58
DPB4Q04603 SNM1YDR478W 597 nt5.21□□□□□ -1.58
DPB4Q04603 TMT1YER175C 900 nt5.21□□□□□ -1.58
DPB4Q04603 CUP2YGL166W 678 nt5.21□□□□□ -1.58
DPB4Q04603 FMP48YGR052W 1110 nt5.21□□□□□ -1.58
DPB4Q04603 YJR085CYJR085C 318 nt5.21□□□□□ -1.58
DPB4Q04603 YKL223WYKL223W 333 nt5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms