Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLH1Q02575 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLH1Q02575 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms