Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK3Q00526 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK3Q00526 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK3Q00526 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms