Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOBP62745 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOBP62745 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOBP62745 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOBP62745 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOBP62745 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHOBP62745 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHOBP62745 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOBP62745 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOBP62745 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOBP62745 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOBP62745 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms