Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GFRA1P56159 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GFRA1P56159 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms