Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LIM2P55344 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIM2P55344 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIM2P55344 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LIM2P55344 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIM2P55344 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIM2P55344 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIM2P55344 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIM2P55344 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIM2P55344 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIM2P55344 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIM2P55344 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIM2P55344 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIM2P55344 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIM2P55344 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIM2P55344 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIM2P55344 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIM2P55344 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LIM2P55344 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIM2P55344 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIM2P55344 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIM2P55344 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIM2P55344 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIM2P55344 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIM2P55344 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIM2P55344 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms