Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LUMP51884 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LUMP51884 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LUMP51884 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LUMP51884 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LUMP51884 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LUMP51884 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LUMP51884 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LUMP51884 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LUMP51884 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LUMP51884 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LUMP51884 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LUMP51884 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LUMP51884 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LUMP51884 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LUMP51884 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LUMP51884 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LUMP51884 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LUMP51884 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LUMP51884 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LUMP51884 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LUMP51884 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
LUMP51884 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LUMP51884 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms