Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPOLAP51003 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLAP51003 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms