Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF10P50591 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms