Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC1P48547 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms