Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ID4P47928 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ID4P47928 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ID4P47928 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ID4P47928 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ID4P47928 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ID4P47928 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ID4P47928 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ID4P47928 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ID4P47928 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ID4P47928 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ID4P47928 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ID4P47928 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ID4P47928 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ID4P47928 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ID4P47928 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ID4P47928 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ID4P47928 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ID4P47928 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ID4P47928 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ID4P47928 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ID4P47928 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ID4P47928 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ID4P47928 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ID4P47928 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ID4P47928 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ID4P47928 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ID4P47928 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ID4P47928 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ID4P47928 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ID4P47928 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms