Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRXP46100 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRXP46100 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRXP46100 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRXP46100 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRXP46100 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRXP46100 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRXP46100 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRXP46100 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRXP46100 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRXP46100 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRXP46100 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRXP46100 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRXP46100 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRXP46100 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRXP46100 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRXP46100 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRXP46100 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRXP46100 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRXP46100 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRXP46100 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRXP46100 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRXP46100 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRXP46100 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRXP46100 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRXP46100 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRXP46100 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRXP46100 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRXP46100 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRXP46100 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRXP46100 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRXP46100 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRXP46100 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRXP46100 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRXP46100 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRXP46100 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRXP46100 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms