Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 MCM6YGL201C 3054 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 IDP1YDL066W 1287 nt5.53□□□□□ -1.52
UFE1P41834 GET3YDL100C 1065 nt5.53□□□□□ -1.52
UFE1P41834 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.53□□□□□ -1.52
UFE1P41834 GEP3YOR205C 1671 nt5.53□□□□□ -1.52
UFE1P41834 HIR1YBL008W 2523 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 CST6YIL036W 1764 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 TOS4YLR183C 1470 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YDR396WYDR396W 501 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 ODC2YOR222W 924 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 RBD2YPL246C 789 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 UBC4YBR082C 447 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 KTR3YBR205W 1215 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 UTP7YER082C 1665 nt5.52□□□□□ -1.53
UFE1P41834 MSN2YMR037C 2115 nt5.51□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YNL108CYNL108C 813 nt5.51□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YPR195CYPR195C 330 nt5.51□□□□□ -1.53
UFE1P41834 STB5YHR178W 2232 nt5.51□□□□□ -1.53
UFE1P41834 PHO8YDR481C 1701 nt5.51□□□□□ -1.53
UFE1P41834 VPS5YOR069W 2028 nt5.5□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YHR127WYHR127W 732 nt5.5□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YHR045WYHR045W 1683 nt5.5□□□□□ -1.53
UFE1P41834 NDC1YML031W 1968 nt5.49□□□□□ -1.53
UFE1P41834 MKK2YPL140C 1521 nt5.49□□□□□ -1.53
UFE1P41834 SOH1YGL127C 384 nt5.49□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YPL041CYPL041C 624 nt5.49□□□□□ -1.53
UFE1P41834 GUA1YMR217W 1578 nt5.49□□□□□ -1.53
UFE1P41834 SNT2YGL131C 4212 nt5.49□□□□□ -1.53
UFE1P41834 OXP1YKL215C 3861 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 TAH18YPR048W 1872 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 CHL4YDR254W 1377 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 IPI1YHR085W 1005 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 POM33YLL023C 840 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YLR283WYLR283W 945 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 YOL131WYOL131W 327 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 VPS1YKR001C 2115 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 DPH2YKL191W 1605 nt5.48□□□□□ -1.53
UFE1P41834 TAX4YJL083W 1815 nt5.47□□□□□ -1.53
UFE1P41834 SCW4YGR279C 1161 nt5.47□□□□□ -1.53
UFE1P41834 CDC11YJR076C 1248 nt5.47□□□□□ -1.53
UFE1P41834 ACF2YLR144C 2340 nt5.47□□□□□ -1.53
UFE1P41834 CLP1YOR250C 1338 nt5.47□□□□□ -1.53
UFE1P41834 TDH3YGR192C 999 nt5.46□□□□□ -1.54
UFE1P41834 YLR317WYLR317W 435 nt5.46□□□□□ -1.54
UFE1P41834 BBP1YPL255W 1158 nt5.46□□□□□ -1.54
UFE1P41834 BAP2YBR068C 1830 nt5.46□□□□□ -1.54
UFE1P41834 ICE2YIL090W 1476 nt5.45□□□□□ -1.54
UFE1P41834 DED81YHR019C 1665 nt5.45□□□□□ -1.54
UFE1P41834 SHO1YER118C 1104 nt5.45□□□□□ -1.54
UFE1P41834 SFC1YJR095W 969 nt5.45□□□□□ -1.54
UFE1P41834 YLR296WYLR296W 327 nt5.45□□□□□ -1.54
UFE1P41834 GYP1YOR070C 1914 nt5.44□□□□□ -1.54
UFE1P41834 YDR541CYDR541C 1035 nt5.44□□□□□ -1.54
UFE1P41834 YJL068CYJL068C 900 nt5.44□□□□□ -1.54
UFE1P41834 CBF1YJR060W 1056 nt5.44□□□□□ -1.54
UFE1P41834 ETR1YBR026C 1143 nt5.44□□□□□ -1.54
UFE1P41834 ENT2YLR206W 1842 nt5.44□□□□□ -1.54
UFE1P41834 MPM1YJL066C 759 nt5.43□□□□□ -1.54
UFE1P41834 ATP14YLR295C 375 nt5.43□□□□□ -1.54
UFE1P41834 RER2YBR002C 861 nt5.43□□□□□ -1.54
UFE1P41834 ALD6YPL061W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
UFE1P41834 GUF1YLR289W 1938 nt5.42□□□□□ -1.54
UFE1P41834 SSK1YLR006C 2139 nt5.42□□□□□ -1.54
UFE1P41834 CLB1YGR108W 1416 nt5.42□□□□□ -1.54
UFE1P41834 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.42□□□□□ -1.54
UFE1P41834 snR32snR32 188 nt5.42□□□□□ -1.54
UFE1P41834 YFL042CYFL042C 2025 nt5.41□□□□□ -1.54
UFE1P41834 PTK2YJR059W 2457 nt5.41□□□□□ -1.54
UFE1P41834 MTQ2YDR140W 666 nt5.41□□□□□ -1.54
UFE1P41834 AMA1YGR225W 1782 nt5.41□□□□□ -1.54
UFE1P41834 HSF1YGL073W 2502 nt5.41□□□□□ -1.54
UFE1P41834 THI21YPL258C 1656 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 CLB2YPR119W 1476 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 UTP18YJL069C 1785 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 FHN1YGR131W 525 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 PRP45YAL032C 1140 nt5.4□□□□□ -1.54
UFE1P41834 PPR1YLR014C 2715 nt5.4□□□□□ -1.55
UFE1P41834 EIS1YMR031C 2532 nt5.4□□□□□ -1.55
UFE1P41834 PIF1YML061C 2580 nt5.4□□□□□ -1.55
UFE1P41834 YFL034WYFL034W 3222 nt5.4□□□□□ -1.55
UFE1P41834 YAP1YML007W 1953 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 CHO1YER026C 831 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 VAM7YGL212W 951 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 NRM1YNR009W 750 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 YBR226CYBR226C 411 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 MTC1YJL123C 1437 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 MAL11YGR289C 1851 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 CIT3YPR001W 1461 nt5.39□□□□□ -1.55
UFE1P41834 BUD14YAR014C 2130 nt5.38□□□□□ -1.55
UFE1P41834 RRP45YDR280W 918 nt5.38□□□□□ -1.55
UFE1P41834 APN1YKL114C 1104 nt5.38□□□□□ -1.55
UFE1P41834 SNU71YGR013W 1863 nt5.38□□□□□ -1.55
UFE1P41834 DBP9YLR276C 1785 nt5.37□□□□□ -1.55
UFE1P41834 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.37□□□□□ -1.55
UFE1P41834 RHO3YIL118W 696 nt5.37□□□□□ -1.55
UFE1P41834 MTQ1YNL063W 945 nt5.37□□□□□ -1.55
UFE1P41834 YFL052WYFL052W 1398 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms