Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX19P40855 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX19P40855 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX19P40855 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX19P40855 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX19P40855 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX19P40855 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX19P40855 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX19P40855 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX19P40855 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX19P40855 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX19P40855 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX19P40855 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX19P40855 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX19P40855 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX19P40855 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX19P40855 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX19P40855 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX19P40855 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX19P40855 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX19P40855 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX19P40855 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX19P40855 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX19P40855 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX19P40855 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX19P40855 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms