Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP8P40818 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP8P40818 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP8P40818 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP8P40818 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP8P40818 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP8P40818 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP8P40818 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP8P40818 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP8P40818 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP8P40818 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP8P40818 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP8P40818 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP8P40818 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP8P40818 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP8P40818 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP8P40818 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP8P40818 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP8P40818 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP8P40818 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP8P40818 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP8P40818 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP8P40818 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP8P40818 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP8P40818 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP8P40818 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP8P40818 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP8P40818 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP8P40818 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP8P40818 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP8P40818 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP8P40818 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP8P40818 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP8P40818 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP8P40818 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP8P40818 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP8P40818 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP8P40818 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP8P40818 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms