Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP12P39900 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP12P39900 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP12P39900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP12P39900 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP12P39900 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP12P39900 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP12P39900 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP12P39900 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP12P39900 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP12P39900 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP12P39900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP12P39900 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP12P39900 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP12P39900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP12P39900 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP12P39900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP12P39900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP12P39900 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP12P39900 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP12P39900 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP12P39900 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP12P39900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP12P39900 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP12P39900 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP12P39900 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP12P39900 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP12P39900 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP12P39900 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP12P39900 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP12P39900 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP12P39900 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP12P39900 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP12P39900 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP12P39900 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP12P39900 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP12P39900 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP12P39900 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP12P39900 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP12P39900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP12P39900 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms