Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	ATG12	YBR217W	561 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SRP101	YDR292C	1866 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	HRP1	YOL123W	1605 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	UTP9	YHR196W	1728 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	MND2	YIR025W	1107 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	PHO86	YJL117W	936 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	IME2	YJL106W	1938 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	DPH2	YKL191W	1605 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YDL023C	YDL023C	321 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YGR176W	YGR176W	348 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	snR32	snR32	188 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	MET8	YBR213W	825 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	ORC5	YNL261W	1440 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YFL034W	YFL034W	3222 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	CCZ1	YBR131W	2115 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SYG1	YIL047C	2709 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	PGA3	YML125C	939 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SPG4	YMR107W	348 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YPR195C	YPR195C	330 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	STE50	YCL032W	1041 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SNU71	YGR013W	1863 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	FRE3	YOR381W	2136 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	MRK1	YDL079C	1506 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SEC17	YBL050W	879 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	UBC4	YBR082C	447 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	HES1	YOR237W	1305 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YMR027W	YMR027W	1413 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	BIT2	YBR270C	1638 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	MNS1	YJR131W	1650 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YNR048W	YNR048W	1182 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	DED81	YHR019C	1665 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	DAK1	YML070W	1755 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	RRN3	YKL125W	1884 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	BPL1	YDL141W	2073 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	QDR1	YIL120W	1692 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	GEP3	YOR205C	1671 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SLT2	YHR030C	1455 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	RHO3	YIL118W	696 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	MOG1	YJR074W	657 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	RPS19B	YNL302C	435 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	LEM3	YNL323W	1245 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	ENV9	YOR246C	993 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SHE2	P36068	SHE10	YGL228W	1734 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YDL121C	YDL121C	450 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PAN6	YIL145C	930 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	RPA49	YNL248C	1248 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	GPM3	YOL056W	912 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PDB1	YBR221C	1101 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	SHM1	YBR263W	1473 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	NOP2	YNL061W	1857 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	ZRT2	YLR130C	1269 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	RPO26	YPR187W	468 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	ACS2	YLR153C	2052 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	DBF4	YDR052C	2115 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	KIP2	YPL155C	2121 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YCR047W-A	YCR047W-A	207 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	POR2	YIL114C	846 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YJL107C	YJL107C	1164 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	NRM1	YNR009W	750 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YOR024W	YOR024W	324 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	QRI1	YDL103C	1434 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	VAN1	YML115C	1608 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YMR155W	YMR155W	1644 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	RBA50	YDR527W	1320 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	FYV1	YDR024W	486 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	EXO1	YOR033C	2109 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PIN2	YOR104W	849 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	CAM1	YPL048W	1248 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	ENV7	YPL236C	1095 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	RAD53	YPL153C	2466 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	RPT1	YKL145W	1404 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YDR154C	YDR154C	351 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	DFM1	YDR411C	1026 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	SCO1	YBR037C	888 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	COX11	YPL132W	903 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PUF3	YLL013C	2640 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YNL095C	YNL095C	1929 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	CYK3	YDL117W	2658 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PRS2	YER099C	957 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	XPT1	YJR133W	630 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	CTR3	YLR411W	726 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	DCI1	YOR180C	816 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PUS1	YPL212C	1635 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	MCX1	YBR227C	1563 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	PDI1	YCL043C	1569 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SHE2	P36068	FOB1	YDR110W	1701 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	PPR1	YLR014C	2715 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	SIT1	YEL065W	1887 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	TFC6	YDR362C	2019 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	ULA1	YPL003W	1389 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	OCA5	YHL029C	2040 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	ARP1	YHR129C	1155 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SHE2	P36068	PDR16	YNL231C	1056 nt		4.76	□□□□□ -1.65

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