Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DMAP28067 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms