Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
YY1P25490 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
YY1P25490 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
YY1P25490 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
YY1P25490 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
YY1P25490 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
YY1P25490 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
YY1P25490 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
YY1P25490 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
YY1P25490 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
YY1P25490 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
YY1P25490 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
YY1P25490 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
YY1P25490 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
YY1P25490 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
YY1P25490 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
YY1P25490 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
YY1P25490 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
YY1P25490 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
YY1P25490 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
YY1P25490 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
YY1P25490 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
YY1P25490 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
YY1P25490 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
YY1P25490 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
YY1P25490 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
YY1P25490 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
YY1P25490 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
YY1P25490 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
YY1P25490 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YY1P25490 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
YY1P25490 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
YY1P25490 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
YY1P25490 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YY1P25490 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YY1P25490 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YY1P25490 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YY1P25490 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YY1P25490 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YY1P25490 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YY1P25490 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YY1P25490 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YY1P25490 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YY1P25490 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YY1P25490 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YY1P25490 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
YY1P25490 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YY1P25490 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YY1P25490 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
YY1P25490 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YY1P25490 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
YY1P25490 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
YY1P25490 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YY1P25490 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
YY1P25490 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
YY1P25490 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YY1P25490 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
YY1P25490 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
YY1P25490 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YY1P25490 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YY1P25490 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YY1P25490 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YY1P25490 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
YY1P25490 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
YY1P25490 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YY1P25490 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
YY1P25490 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YY1P25490 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YY1P25490 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YY1P25490 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
YY1P25490 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YY1P25490 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YY1P25490 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YY1P25490 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YY1P25490 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms