Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRZ1P23471 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRZ1P23471 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRZ1P23471 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms