Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFAPP14136 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFAPP14136 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GFAPP14136 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFAPP14136 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFAPP14136 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GFAPP14136 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFAPP14136 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFAPP14136 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFAPP14136 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFAPP14136 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFAPP14136 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms