Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNT1P13805 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT1P13805 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms