Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLBP06746 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLBP06746 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLBP06746 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLBP06746 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLBP06746 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLBP06746 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLBP06746 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLBP06746 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLBP06746 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLBP06746 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLBP06746 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLBP06746 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLBP06746 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLBP06746 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLBP06746 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLBP06746 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLBP06746 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLBP06746 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLBP06746 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLBP06746 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLBP06746 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLBP06746 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLBP06746 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLBP06746 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLBP06746 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLBP06746 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLBP06746 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLBP06746 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLBP06746 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLBP06746 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLBP06746 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLBP06746 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms