Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A1P02730 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms