Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX4O95219 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX4O95219 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX4O95219 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX4O95219 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX4O95219 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX4O95219 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX4O95219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX4O95219 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX4O95219 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX4O95219 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX4O95219 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX4O95219 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX4O95219 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX4O95219 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX4O95219 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX4O95219 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX4O95219 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX4O95219 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms