Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F6O75461 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F6O75461 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F6O75461 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F6O75461 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F6O75461 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F6O75461 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F6O75461 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F6O75461 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F6O75461 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F6O75461 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F6O75461 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F6O75461 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F6O75461 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F6O75461 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F6O75461 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F6O75461 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F6O75461 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F6O75461 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F6O75461 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F6O75461 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F6O75461 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F6O75461 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F6O75461 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F6O75461 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F6O75461 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F6O75461 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms