Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUPR1O60356 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUPR1O60356 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms