Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAB2O43741 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms