Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATCO43716 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATCO43716 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATCO43716 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATCO43716 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATCO43716 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATCO43716 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATCO43716 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATCO43716 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATCO43716 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms