Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM44O43615 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIMM44O43615 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM44O43615 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms