Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUPL2O15504 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUPL2O15504 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms