Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
O00370 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
O00370 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
O00370 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
O00370 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
O00370 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
O00370 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
O00370 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
O00370 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
O00370 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
O00370 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
O00370 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
O00370 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
O00370 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
O00370 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
O00370 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
O00370 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
O00370 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
O00370 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
O00370 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
O00370 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
O00370 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
O00370 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
O00370 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
O00370 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
O00370 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
O00370 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
O00370 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
O00370 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
O00370 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
O00370 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
O00370 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
O00370 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
O00370 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
O00370 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
O00370 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms