Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP42A6NI28 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGAP42A6NI28 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP42A6NI28 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms