Protein–RNA interactions for Protein: Q02863

UBP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, yeastyeast

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP16Q02863 YPS1YLR120C 1710 nt14.91□□□□□ -0.02
UBP16Q02863 MRPL8YJL063C 717 nt14.87□□□□□ -0.03
UBP16Q02863 YDR095CYDR095C 411 nt14.85□□□□□ -0.03
UBP16Q02863 ALF1YNL148C 765 nt14.85□□□□□ -0.03
UBP16Q02863 LPX1YOR084W 1164 nt14.84□□□□□ -0.03
UBP16Q02863 YJL152WYJL152W 360 nt14.82□□□□□ -0.04
UBP16Q02863 SPP1YPL138C 1062 nt14.8□□□□□ -0.04
UBP16Q02863 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.77□□□□□ -0.05
UBP16Q02863 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.77□□□□□ -0.05
UBP16Q02863 SPT5YML010W 3192 nt14.72□□□□□ -0.05
UBP16Q02863 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.72□□□□□ -0.05
UBP16Q02863 ERV46YAL042W 1248 nt14.7□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 SIS1YNL007C 1059 nt14.68□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.67□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 YEL076CYEL076C 651 nt14.67□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 YLR464WYLR464W 651 nt14.67□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 UBX6YJL048C 1191 nt14.66□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 ADO1YJR105W 1023 nt14.66□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 IDH1YNL037C 1083 nt14.66□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 YDR433WYDR433W 441 nt14.65□□□□□ -0.06
UBP16Q02863 TIR4YOR009W 1464 nt14.63□□□□□ -0.07
UBP16Q02863 RTG1YOL067C 534 nt14.62□□□□□ -0.07
UBP16Q02863 MEP2YNL142W 1500 nt14.58□□□□□ -0.08
UBP16Q02863 PTP1YDL230W 1008 nt14.57□□□□□ -0.08
UBP16Q02863 RPP2AYOL039W 321 nt14.55□□□□□ -0.08
UBP16Q02863 YKR040CYKR040C 504 nt14.53□□□□□ -0.08
UBP16Q02863 MXR2YCL033C 507 nt14.53□□□□□ -0.08
UBP16Q02863 GBP2YCL011C 1284 nt14.51□□□□□ -0.09
UBP16Q02863 ART5YGR068C 1761 nt14.51□□□□□ -0.09
UBP16Q02863 DCW1YKL046C 1350 nt14.47□□□□□ -0.09
UBP16Q02863 CAC2YML102W 1407 nt14.42□□□□□ -0.1
UBP16Q02863 GFD2YCL036W 1701 nt14.42□□□□□ -0.1
UBP16Q02863 YMR057CYMR057C 372 nt14.42□□□□□ -0.1
UBP16Q02863 PET9YBL030C 957 nt14.36□□□□□ -0.11
UBP16Q02863 HUA1YGR268C 597 nt14.3□□□□□ -0.12
UBP16Q02863 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.29□□□□□ -0.12
UBP16Q02863 RTS2YOR077W 699 nt14.27□□□□□ -0.13
UBP16Q02863 TCD2YKL027W 1344 nt14.24□□□□□ -0.13
UBP16Q02863 YDR094WYDR094W 336 nt14.22□□□□□ -0.13
UBP16Q02863 EMI2YDR516C 1503 nt14.21□□□□□ -0.13
UBP16Q02863 FPS1YLL043W 2010 nt14.19□□□□□ -0.14
UBP16Q02863 IRC15YPL017C 1500 nt14.19□□□□□ -0.14
UBP16Q02863 FRD1YEL047C 1413 nt14.16□□□□□ -0.14
UBP16Q02863 DED1YOR204W 1815 nt14.14□□□□□ -0.15
UBP16Q02863 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.14□□□□□ -0.15
UBP16Q02863 YDL221WYDL221W 552 nt14.13□□□□□ -0.15
UBP16Q02863 PTH1YHR189W 573 nt14.13□□□□□ -0.15
UBP16Q02863 RRD1YIL153W 1182 nt14.11□□□□□ -0.15
UBP16Q02863 GIS3YLR094C 1509 nt14.07□□□□□ -0.16
UBP16Q02863 CUE1YMR264W 612 nt14.02□□□□□ -0.17
UBP16Q02863 FMT1YBL013W 1206 nt14.01□□□□□ -0.17
UBP16Q02863 SSA4YER103W 1929 nt14.01□□□□□ -0.17
UBP16Q02863 YKL030WYKL030W 606 nt13.99□□□□□ -0.17
UBP16Q02863 YCL042WYCL042W 360 nt13.99□□□□□ -0.17
UBP16Q02863 YLR235CYLR235C 399 nt13.94□□□□□ -0.18
UBP16Q02863 YMR090WYMR090W 684 nt13.94□□□□□ -0.18
UBP16Q02863 LCB1YMR296C 1677 nt13.93□□□□□ -0.18
UBP16Q02863 SOR2YDL246C 1074 nt13.91□□□□□ -0.18
UBP16Q02863 SOR1YJR159W 1074 nt13.91□□□□□ -0.18
UBP16Q02863 SDH1YKL148C 1923 nt13.9□□□□□ -0.18
UBP16Q02863 YBR220CYBR220C 1683 nt13.87□□□□□ -0.19
UBP16Q02863 SCC4YER147C 1875 nt13.87□□□□□ -0.19
UBP16Q02863 YIL100WYIL100W 354 nt13.8□□□□□ -0.2
UBP16Q02863 CWP1YKL096W 720 nt13.8□□□□□ -0.2
UBP16Q02863 SBA1YKL117W 651 nt13.79□□□□□ -0.2
UBP16Q02863 PAU16YKL224C 372 nt13.79□□□□□ -0.2
UBP16Q02863 ADH2YMR303C 1047 nt13.76□□□□□ -0.21
UBP16Q02863 FMP52YER004W 696 nt13.72□□□□□ -0.21
UBP16Q02863 PRE6YOL038W 765 nt13.71□□□□□ -0.21
UBP16Q02863 TIM23YNR017W 669 nt13.69□□□□□ -0.22
UBP16Q02863 YFR018CYFR018C 1092 nt13.67□□□□□ -0.22
UBP16Q02863 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.66□□□□□ -0.22
UBP16Q02863 DIC1YLR348C 897 nt13.65□□□□□ -0.22
UBP16Q02863 PCM1YEL058W 1674 nt13.63□□□□□ -0.23
UBP16Q02863 RRT5YFR032C 870 nt13.62□□□□□ -0.23
UBP16Q02863 RRT12YCR045C 1476 nt13.61□□□□□ -0.23
UBP16Q02863 YLR179CYLR179C 606 nt13.6□□□□□ -0.23
UBP16Q02863 SNF6YHL025W 999 nt13.55□□□□□ -0.24
UBP16Q02863 YSC84YHR016C 1407 nt13.52□□□□□ -0.25
UBP16Q02863 YPR064WYPR064W 420 nt13.51□□□□□ -0.25
UBP16Q02863 YHL050CYHL050C 2094 nt13.5□□□□□ -0.25
UBP16Q02863 YNL195CYNL195C 786 nt13.48□□□□□ -0.25
UBP16Q02863 TAD3YLR316C 969 nt13.47□□□□□ -0.25
UBP16Q02863 WSC2YNL283C 1512 nt13.47□□□□□ -0.25
UBP16Q02863 YFL066CYFL066C 1179 nt13.45□□□□□ -0.26
UBP16Q02863 YIH1YCR059C 777 nt13.44□□□□□ -0.26
UBP16Q02863 RNQ1YCL028W 1218 nt13.44□□□□□ -0.26
UBP16Q02863 BDF1YLR399C 2061 nt13.43□□□□□ -0.26
UBP16Q02863 AHT1YHR093W 549 nt13.4□□□□□ -0.26
UBP16Q02863 BIO4YNR057C 714 nt13.37□□□□□ -0.27
UBP16Q02863 YLL053CYLL053C 459 nt13.35□□□□□ -0.27
UBP16Q02863 PEX25YPL112C 1185 nt13.34□□□□□ -0.27
UBP16Q02863 SIM1YIL123W 1431 nt13.32□□□□□ -0.28
UBP16Q02863 NAT4YMR069W 858 nt13.29□□□□□ -0.28
UBP16Q02863 BDH1YAL060W 1149 nt13.26□□□□□ -0.29
UBP16Q02863 YNL115CYNL115C 1935 nt13.25□□□□□ -0.29
UBP16Q02863 TAT1YBR069C 1860 nt13.25□□□□□ -0.29
UBP16Q02863 YSP3YOR003W 1437 nt13.24□□□□□ -0.29
UBP16Q02863 FTR1YER145C 1215 nt13.24□□□□□ -0.29
UBP16Q02863 GAL1YBR020W 1587 nt13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms