Protein–RNA interactions for Protein: P53941

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IMP4P53941 SPT5YML010W 3192 nt12.51□□□□□ -0.41
IMP4P53941 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
IMP4P53941 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.5□□□□□ -0.41
IMP4P53941 YPR011CYPR011C 981 nt12.47□□□□□ -0.41
IMP4P53941 YLR236CYLR236C 324 nt12.44□□□□□ -0.42
IMP4P53941 ALF1YNL148C 765 nt12.44□□□□□ -0.42
IMP4P53941 ADO1YJR105W 1023 nt12.37□□□□□ -0.43
IMP4P53941 YJL152WYJL152W 360 nt12.34□□□□□ -0.43
IMP4P53941 IDH1YNL037C 1083 nt12.3□□□□□ -0.44
IMP4P53941 ERV46YAL042W 1248 nt12.28□□□□□ -0.44
IMP4P53941 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.23□□□□□ -0.45
IMP4P53941 YEL076CYEL076C 651 nt12.23□□□□□ -0.45
IMP4P53941 YLR464WYLR464W 651 nt12.23□□□□□ -0.45
IMP4P53941 LPX1YOR084W 1164 nt12.23□□□□□ -0.45
IMP4P53941 PAC11YDR488C 1602 nt12.22□□□□□ -0.45
IMP4P53941 BDF1YLR399C 2061 nt12.22□□□□□ -0.45
IMP4P53941 YPS1YLR120C 1710 nt12.21□□□□□ -0.45
IMP4P53941 YDR095CYDR095C 411 nt12.21□□□□□ -0.45
IMP4P53941 SIS1YNL007C 1059 nt12.19□□□□□ -0.46
IMP4P53941 YDR433WYDR433W 441 nt12.17□□□□□ -0.46
IMP4P53941 YKR040CYKR040C 504 nt12.17□□□□□ -0.46
IMP4P53941 RTG1YOL067C 534 nt12.11□□□□□ -0.47
IMP4P53941 SPP1YPL138C 1062 nt12.11□□□□□ -0.47
IMP4P53941 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.09□□□□□ -0.47
IMP4P53941 GBP2YCL011C 1284 nt12.09□□□□□ -0.47
IMP4P53941 UBX6YJL048C 1191 nt12.06□□□□□ -0.48
IMP4P53941 TAT1YBR069C 1860 nt12.05□□□□□ -0.48
IMP4P53941 TIR4YOR009W 1464 nt12.03□□□□□ -0.48
IMP4P53941 RPP2AYOL039W 321 nt12.01□□□□□ -0.49
IMP4P53941 HUA1YGR268C 597 nt12□□□□□ -0.49
IMP4P53941 CAC2YML102W 1407 nt11.99□□□□□ -0.49
IMP4P53941 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.96□□□□□ -0.49
IMP4P53941 PET9YBL030C 957 nt11.95□□□□□ -0.5
IMP4P53941 MXR2YCL033C 507 nt11.95□□□□□ -0.5
IMP4P53941 TCD2YKL027W 1344 nt11.92□□□□□ -0.5
IMP4P53941 ART5YGR068C 1761 nt11.9□□□□□ -0.51
IMP4P53941 YMR057CYMR057C 372 nt11.89□□□□□ -0.51
IMP4P53941 NVJ2YPR091C 2313 nt11.89□□□□□ -0.51
IMP4P53941 YDR094WYDR094W 336 nt11.88□□□□□ -0.51
IMP4P53941 PTP1YDL230W 1008 nt11.83□□□□□ -0.52
IMP4P53941 MEP2YNL142W 1500 nt11.8□□□□□ -0.52
IMP4P53941 GFD2YCL036W 1701 nt11.79□□□□□ -0.52
IMP4P53941 FRD1YEL047C 1413 nt11.74□□□□□ -0.53
IMP4P53941 YCL042WYCL042W 360 nt11.73□□□□□ -0.53
IMP4P53941 YLR235CYLR235C 399 nt11.72□□□□□ -0.53
IMP4P53941 DED1YOR204W 1815 nt11.7□□□□□ -0.54
IMP4P53941 YKL030WYKL030W 606 nt11.7□□□□□ -0.54
IMP4P53941 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.68□□□□□ -0.54
IMP4P53941 RRD1YIL153W 1182 nt11.67□□□□□ -0.54
IMP4P53941 PTH1YHR189W 573 nt11.64□□□□□ -0.55
IMP4P53941 FPS1YLL043W 2010 nt11.64□□□□□ -0.55
IMP4P53941 SOR2YDL246C 1074 nt11.63□□□□□ -0.55
IMP4P53941 SOR1YJR159W 1074 nt11.63□□□□□ -0.55
IMP4P53941 FMP52YER004W 696 nt11.56□□□□□ -0.56
IMP4P53941 RTS2YOR077W 699 nt11.55□□□□□ -0.56
IMP4P53941 LCB1YMR296C 1677 nt11.55□□□□□ -0.56
IMP4P53941 DCW1YKL046C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
IMP4P53941 FMT1YBL013W 1206 nt11.54□□□□□ -0.56
IMP4P53941 CUE1YMR264W 612 nt11.54□□□□□ -0.56
IMP4P53941 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
IMP4P53941 EMI2YDR516C 1503 nt11.5□□□□□ -0.57
IMP4P53941 YBR220CYBR220C 1683 nt11.49□□□□□ -0.57
IMP4P53941 YDL221WYDL221W 552 nt11.46□□□□□ -0.57
IMP4P53941 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.46□□□□□ -0.57
IMP4P53941 IRC15YPL017C 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
IMP4P53941 RRT5YFR032C 870 nt11.45□□□□□ -0.58
IMP4P53941 YIL100WYIL100W 354 nt11.45□□□□□ -0.58
IMP4P53941 CWP1YKL096W 720 nt11.45□□□□□ -0.58
IMP4P53941 YFR018CYFR018C 1092 nt11.44□□□□□ -0.58
IMP4P53941 TIM23YNR017W 669 nt11.43□□□□□ -0.58
IMP4P53941 PAU16YKL224C 372 nt11.39□□□□□ -0.59
IMP4P53941 GIS3YLR094C 1509 nt11.38□□□□□ -0.59
IMP4P53941 ADH2YMR303C 1047 nt11.37□□□□□ -0.59
IMP4P53941 PCH2YBR186W 1695 nt11.36□□□□□ -0.59
IMP4P53941 YPR064WYPR064W 420 nt11.36□□□□□ -0.59
IMP4P53941 DIC1YLR348C 897 nt11.35□□□□□ -0.59
IMP4P53941 YLR179CYLR179C 606 nt11.34□□□□□ -0.59
IMP4P53941 SNF6YHL025W 999 nt11.32□□□□□ -0.6
IMP4P53941 SEC11YIR022W 504 nt11.32□□□□□ -0.6
IMP4P53941 GUT2YIL155C 1950 nt11.32□□□□□ -0.6
IMP4P53941 YJL225CYJL225C 5277 nt11.3□□□□□ -0.6
IMP4P53941 SBA1YKL117W 651 nt11.3□□□□□ -0.6
IMP4P53941 PCM1YEL058W 1674 nt11.28□□□□□ -0.6
IMP4P53941 TAD3YLR316C 969 nt11.28□□□□□ -0.6
IMP4P53941 SDH1YKL148C 1923 nt11.28□□□□□ -0.6
IMP4P53941 RNQ1YCL028W 1218 nt11.27□□□□□ -0.61
IMP4P53941 SCC4YER147C 1875 nt11.24□□□□□ -0.61
IMP4P53941 PRE6YOL038W 765 nt11.22□□□□□ -0.61
IMP4P53941 YIH1YCR059C 777 nt11.21□□□□□ -0.61
IMP4P53941 AHT1YHR093W 549 nt11.21□□□□□ -0.61
IMP4P53941 YNL195CYNL195C 786 nt11.17□□□□□ -0.62
IMP4P53941 WSC2YNL283C 1512 nt11.17□□□□□ -0.62
IMP4P53941 AQY1YPR192W 918 nt11.16□□□□□ -0.62
IMP4P53941 NAT4YMR069W 858 nt11.15□□□□□ -0.62
IMP4P53941 PEX25YPL112C 1185 nt11.12□□□□□ -0.63
IMP4P53941 YFL066CYFL066C 1179 nt11.08□□□□□ -0.64
IMP4P53941 GLK1YCL040W 1503 nt11.07□□□□□ -0.64
IMP4P53941 YLL053CYLL053C 459 nt11.05□□□□□ -0.64
IMP4P53941 YSC84YHR016C 1407 nt11.04□□□□□ -0.64
IMP4P53941 YLR415CYLR415C 339 nt11.04□□□□□ -0.64
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