Protein–RNA interactions for Protein: P40897

OPT1, Oligopeptide transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OPT1P40897 CCT6YDR188W 1641 nt13.12□□□□□ -0.31
OPT1P40897 LPX1YOR084W 1164 nt13□□□□□ -0.33
OPT1P40897 YJL152WYJL152W 360 nt12.98□□□□□ -0.33
OPT1P40897 ADO1YJR105W 1023 nt12.98□□□□□ -0.33
OPT1P40897 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.97□□□□□ -0.33
OPT1P40897 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.97□□□□□ -0.33
OPT1P40897 SPP1YPL138C 1062 nt12.97□□□□□ -0.33
OPT1P40897 ALF1YNL148C 765 nt12.96□□□□□ -0.33
OPT1P40897 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.94□□□□□ -0.34
OPT1P40897 YEL076CYEL076C 651 nt12.94□□□□□ -0.34
OPT1P40897 YLR464WYLR464W 651 nt12.94□□□□□ -0.34
OPT1P40897 UBX6YJL048C 1191 nt12.93□□□□□ -0.34
OPT1P40897 ERV46YAL042W 1248 nt12.93□□□□□ -0.34
OPT1P40897 IDH1YNL037C 1083 nt12.88□□□□□ -0.35
OPT1P40897 RTG1YOL067C 534 nt12.87□□□□□ -0.35
OPT1P40897 YDR433WYDR433W 441 nt12.85□□□□□ -0.35
OPT1P40897 SIS1YNL007C 1059 nt12.82□□□□□ -0.36
OPT1P40897 SPT5YML010W 3192 nt12.81□□□□□ -0.36
OPT1P40897 YKR040CYKR040C 504 nt12.79□□□□□ -0.36
OPT1P40897 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
OPT1P40897 YPS1YLR120C 1710 nt12.76□□□□□ -0.37
OPT1P40897 GBP2YCL011C 1284 nt12.73□□□□□ -0.37
OPT1P40897 MXR2YCL033C 507 nt12.71□□□□□ -0.37
OPT1P40897 TIR4YOR009W 1464 nt12.71□□□□□ -0.38
OPT1P40897 HUA1YGR268C 597 nt12.62□□□□□ -0.39
OPT1P40897 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.61□□□□□ -0.39
OPT1P40897 YDR094WYDR094W 336 nt12.57□□□□□ -0.4
OPT1P40897 CAC2YML102W 1407 nt12.55□□□□□ -0.4
OPT1P40897 MEP2YNL142W 1500 nt12.55□□□□□ -0.4
OPT1P40897 YMR057CYMR057C 372 nt12.53□□□□□ -0.4
OPT1P40897 RPP2AYOL039W 321 nt12.53□□□□□ -0.4
OPT1P40897 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.52□□□□□ -0.41
OPT1P40897 ART5YGR068C 1761 nt12.51□□□□□ -0.41
OPT1P40897 TCD2YKL027W 1344 nt12.49□□□□□ -0.41
OPT1P40897 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.49□□□□□ -0.41
OPT1P40897 PET9YBL030C 957 nt12.47□□□□□ -0.41
OPT1P40897 PTP1YDL230W 1008 nt12.44□□□□□ -0.42
OPT1P40897 FRD1YEL047C 1413 nt12.41□□□□□ -0.42
OPT1P40897 GFD2YCL036W 1701 nt12.4□□□□□ -0.43
OPT1P40897 DCW1YKL046C 1350 nt12.38□□□□□ -0.43
OPT1P40897 DED1YOR204W 1815 nt12.37□□□□□ -0.43
OPT1P40897 PTH1YHR189W 573 nt12.37□□□□□ -0.43
OPT1P40897 SSA4YER103W 1929 nt12.34□□□□□ -0.43
OPT1P40897 RRD1YIL153W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
OPT1P40897 YKL030WYKL030W 606 nt12.32□□□□□ -0.44
OPT1P40897 YLR235CYLR235C 399 nt12.27□□□□□ -0.45
OPT1P40897 YCL042WYCL042W 360 nt12.27□□□□□ -0.45
OPT1P40897 FPS1YLL043W 2010 nt12.25□□□□□ -0.45
OPT1P40897 FMT1YBL013W 1206 nt12.23□□□□□ -0.45
OPT1P40897 LCB1YMR296C 1677 nt12.22□□□□□ -0.45
OPT1P40897 RTS2YOR077W 699 nt12.21□□□□□ -0.45
OPT1P40897 EMI2YDR516C 1503 nt12.21□□□□□ -0.46
OPT1P40897 SOR2YDL246C 1074 nt12.2□□□□□ -0.46
OPT1P40897 SOR1YJR159W 1074 nt12.2□□□□□ -0.46
OPT1P40897 SBA1YKL117W 651 nt12.16□□□□□ -0.46
OPT1P40897 PAU16YKL224C 372 nt12.13□□□□□ -0.47
OPT1P40897 YDL221WYDL221W 552 nt12.12□□□□□ -0.47
OPT1P40897 IRC15YPL017C 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
OPT1P40897 YFR018CYFR018C 1092 nt12.06□□□□□ -0.48
OPT1P40897 CWP1YKL096W 720 nt12.06□□□□□ -0.48
OPT1P40897 YMR090WYMR090W 684 nt12.06□□□□□ -0.48
OPT1P40897 CUE1YMR264W 612 nt12.06□□□□□ -0.48
OPT1P40897 FMP52YER004W 696 nt12.03□□□□□ -0.48
OPT1P40897 RRT5YFR032C 870 nt12.03□□□□□ -0.48
OPT1P40897 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.03□□□□□ -0.48
OPT1P40897 PRE6YOL038W 765 nt12.02□□□□□ -0.49
OPT1P40897 ADH2YMR303C 1047 nt12.01□□□□□ -0.49
OPT1P40897 TIM23YNR017W 669 nt12.01□□□□□ -0.49
OPT1P40897 YBR220CYBR220C 1683 nt12□□□□□ -0.49
OPT1P40897 SDH1YKL148C 1923 nt11.97□□□□□ -0.49
OPT1P40897 GIS3YLR094C 1509 nt11.96□□□□□ -0.5
OPT1P40897 DIC1YLR348C 897 nt11.95□□□□□ -0.5
OPT1P40897 YLR179CYLR179C 606 nt11.93□□□□□ -0.5
OPT1P40897 YIL100WYIL100W 354 nt11.92□□□□□ -0.5
OPT1P40897 SCC4YER147C 1875 nt11.89□□□□□ -0.51
OPT1P40897 YPR064WYPR064W 420 nt11.89□□□□□ -0.51
OPT1P40897 BDF1YLR399C 2061 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT1P40897 SNF6YHL025W 999 nt11.86□□□□□ -0.51
OPT1P40897 TAD3YLR316C 969 nt11.85□□□□□ -0.51
OPT1P40897 PCM1YEL058W 1674 nt11.84□□□□□ -0.51
OPT1P40897 YFL066CYFL066C 1179 nt11.81□□□□□ -0.52
OPT1P40897 WSC2YNL283C 1512 nt11.8□□□□□ -0.52
OPT1P40897 RNQ1YCL028W 1218 nt11.79□□□□□ -0.52
OPT1P40897 AHT1YHR093W 549 nt11.78□□□□□ -0.52
OPT1P40897 YIH1YCR059C 777 nt11.76□□□□□ -0.53
OPT1P40897 NAT4YMR069W 858 nt11.73□□□□□ -0.53
OPT1P40897 PEX25YPL112C 1185 nt11.72□□□□□ -0.53
OPT1P40897 TAT1YBR069C 1860 nt11.71□□□□□ -0.53
OPT1P40897 YSP3YOR003W 1437 nt11.63□□□□□ -0.55
OPT1P40897 YNL115CYNL115C 1935 nt11.63□□□□□ -0.55
OPT1P40897 BDH1YAL060W 1149 nt11.63□□□□□ -0.55
OPT1P40897 YLL053CYLL053C 459 nt11.63□□□□□ -0.55
OPT1P40897 GLK1YCL040W 1503 nt11.63□□□□□ -0.55
OPT1P40897 YSC84YHR016C 1407 nt11.61□□□□□ -0.55
OPT1P40897 Q0182Q0182 405 nt11.61□□□□□ -0.55
OPT1P40897 AQY1YPR192W 918 nt11.59□□□□□ -0.55
OPT1P40897 RRT12YCR045C 1476 nt11.58□□□□□ -0.56
OPT1P40897 FTR1YER145C 1215 nt11.58□□□□□ -0.56
OPT1P40897 MSF1YPR047W 1410 nt11.58□□□□□ -0.56
OPT1P40897 YHL050CYHL050C 2094 nt11.57□□□□□ -0.56
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