Protein–RNA interactions for Protein: P38324

SLX1, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX1P38324 MRPL8YJL063C 717 nt13.1□□□□□ -0.31
SLX1P38324 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.04□□□□□ -0.32
SLX1P38324 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.04□□□□□ -0.32
SLX1P38324 YJL152WYJL152W 360 nt13.04□□□□□ -0.32
SLX1P38324 ALF1YNL148C 765 nt13.04□□□□□ -0.32
SLX1P38324 LPX1YOR084W 1164 nt13□□□□□ -0.33
SLX1P38324 SPP1YPL138C 1062 nt12.96□□□□□ -0.33
SLX1P38324 ADO1YJR105W 1023 nt12.93□□□□□ -0.34
SLX1P38324 ERV46YAL042W 1248 nt12.92□□□□□ -0.34
SLX1P38324 IDH1YNL037C 1083 nt12.92□□□□□ -0.34
SLX1P38324 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.89□□□□□ -0.35
SLX1P38324 YEL076CYEL076C 651 nt12.89□□□□□ -0.35
SLX1P38324 YLR464WYLR464W 651 nt12.89□□□□□ -0.35
SLX1P38324 YDR433WYDR433W 441 nt12.88□□□□□ -0.35
SLX1P38324 UBX6YJL048C 1191 nt12.85□□□□□ -0.35
SLX1P38324 YPS1YLR120C 1710 nt12.85□□□□□ -0.35
SLX1P38324 YDR095CYDR095C 411 nt12.84□□□□□ -0.35
SLX1P38324 RTG1YOL067C 534 nt12.82□□□□□ -0.36
SLX1P38324 SIS1YNL007C 1059 nt12.81□□□□□ -0.36
SLX1P38324 YKR040CYKR040C 504 nt12.8□□□□□ -0.36
SLX1P38324 SPT5YML010W 3192 nt12.77□□□□□ -0.36
SLX1P38324 GBP2YCL011C 1284 nt12.77□□□□□ -0.37
SLX1P38324 TIR4YOR009W 1464 nt12.76□□□□□ -0.37
SLX1P38324 SSA4YER103W 1929 nt12.73□□□□□ -0.37
SLX1P38324 MXR2YCL033C 507 nt12.73□□□□□ -0.37
SLX1P38324 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.72□□□□□ -0.37
SLX1P38324 RPP2AYOL039W 321 nt12.62□□□□□ -0.39
SLX1P38324 CAC2YML102W 1407 nt12.61□□□□□ -0.39
SLX1P38324 HUA1YGR268C 597 nt12.6□□□□□ -0.39
SLX1P38324 YMR057CYMR057C 372 nt12.6□□□□□ -0.39
SLX1P38324 ART5YGR068C 1761 nt12.59□□□□□ -0.39
SLX1P38324 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.58□□□□□ -0.4
SLX1P38324 TCD2YKL027W 1344 nt12.54□□□□□ -0.4
SLX1P38324 PET9YBL030C 957 nt12.53□□□□□ -0.4
SLX1P38324 PTP1YDL230W 1008 nt12.51□□□□□ -0.41
SLX1P38324 YDR094WYDR094W 336 nt12.51□□□□□ -0.41
SLX1P38324 GFD2YCL036W 1701 nt12.47□□□□□ -0.41
SLX1P38324 FRD1YEL047C 1413 nt12.43□□□□□ -0.42
SLX1P38324 MEP2YNL142W 1500 nt12.41□□□□□ -0.42
SLX1P38324 DED1YOR204W 1815 nt12.4□□□□□ -0.42
SLX1P38324 PTH1YHR189W 573 nt12.4□□□□□ -0.42
SLX1P38324 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.39□□□□□ -0.43
SLX1P38324 RRD1YIL153W 1182 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX1P38324 YKL030WYKL030W 606 nt12.32□□□□□ -0.44
SLX1P38324 YCL042WYCL042W 360 nt12.32□□□□□ -0.44
SLX1P38324 BDF1YLR399C 2061 nt12.31□□□□□ -0.44
SLX1P38324 FPS1YLL043W 2010 nt12.31□□□□□ -0.44
SLX1P38324 RTS2YOR077W 699 nt12.3□□□□□ -0.44
SLX1P38324 YLR235CYLR235C 399 nt12.29□□□□□ -0.44
SLX1P38324 FMT1YBL013W 1206 nt12.27□□□□□ -0.45
SLX1P38324 DCW1YKL046C 1350 nt12.26□□□□□ -0.45
SLX1P38324 LCB1YMR296C 1677 nt12.23□□□□□ -0.45
SLX1P38324 NVJ2YPR091C 2313 nt12.22□□□□□ -0.45
SLX1P38324 SOR2YDL246C 1074 nt12.21□□□□□ -0.45
SLX1P38324 SOR1YJR159W 1074 nt12.21□□□□□ -0.45
SLX1P38324 PAC11YDR488C 1602 nt12.18□□□□□ -0.46
SLX1P38324 TAT1YBR069C 1860 nt12.14□□□□□ -0.47
SLX1P38324 CUE1YMR264W 612 nt12.14□□□□□ -0.47
SLX1P38324 IRC15YPL017C 1500 nt12.14□□□□□ -0.47
SLX1P38324 EMI2YDR516C 1503 nt12.12□□□□□ -0.47
SLX1P38324 CWP1YKL096W 720 nt12.12□□□□□ -0.47
SLX1P38324 PAU16YKL224C 372 nt12.09□□□□□ -0.47
SLX1P38324 FMP52YER004W 696 nt12.07□□□□□ -0.48
SLX1P38324 SBA1YKL117W 651 nt12.07□□□□□ -0.48
SLX1P38324 YDL221WYDL221W 552 nt12.06□□□□□ -0.48
SLX1P38324 ADH2YMR303C 1047 nt12.06□□□□□ -0.48
SLX1P38324 TIM23YNR017W 669 nt12.04□□□□□ -0.48
SLX1P38324 GIS3YLR094C 1509 nt12.04□□□□□ -0.48
SLX1P38324 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.03□□□□□ -0.48
SLX1P38324 YFR018CYFR018C 1092 nt12.02□□□□□ -0.49
SLX1P38324 RRT5YFR032C 870 nt12.01□□□□□ -0.49
SLX1P38324 YIL100WYIL100W 354 nt12.01□□□□□ -0.49
SLX1P38324 YMR090WYMR090W 684 nt11.99□□□□□ -0.49
SLX1P38324 PRE6YOL038W 765 nt11.99□□□□□ -0.49
SLX1P38324 DIC1YLR348C 897 nt11.98□□□□□ -0.49
SLX1P38324 YLR179CYLR179C 606 nt11.96□□□□□ -0.49
SLX1P38324 YPR064WYPR064W 420 nt11.92□□□□□ -0.5
SLX1P38324 SNF6YHL025W 999 nt11.91□□□□□ -0.5
SLX1P38324 PCM1YEL058W 1674 nt11.91□□□□□ -0.5
SLX1P38324 TAD3YLR316C 969 nt11.86□□□□□ -0.51
SLX1P38324 RNQ1YCL028W 1218 nt11.84□□□□□ -0.51
SLX1P38324 SCC4YER147C 1875 nt11.84□□□□□ -0.51
SLX1P38324 WSC2YNL283C 1512 nt11.81□□□□□ -0.52
SLX1P38324 YFL066CYFL066C 1179 nt11.81□□□□□ -0.52
SLX1P38324 SDH1YKL148C 1923 nt11.8□□□□□ -0.52
SLX1P38324 YIH1YCR059C 777 nt11.79□□□□□ -0.52
SLX1P38324 AHT1YHR093W 549 nt11.79□□□□□ -0.52
SLX1P38324 YBR220CYBR220C 1683 nt11.77□□□□□ -0.53
SLX1P38324 NAT4YMR069W 858 nt11.71□□□□□ -0.53
SLX1P38324 PEX25YPL112C 1185 nt11.71□□□□□ -0.53
SLX1P38324 YLL053CYLL053C 459 nt11.68□□□□□ -0.54
SLX1P38324 YNL195CYNL195C 786 nt11.68□□□□□ -0.54
SLX1P38324 YSC84YHR016C 1407 nt11.65□□□□□ -0.54
SLX1P38324 YSP3YOR003W 1437 nt11.64□□□□□ -0.55
SLX1P38324 BDH1YAL060W 1149 nt11.64□□□□□ -0.55
SLX1P38324 GLK1YCL040W 1503 nt11.64□□□□□ -0.55
SLX1P38324 YNL115CYNL115C 1935 nt11.64□□□□□ -0.55
SLX1P38324 FTR1YER145C 1215 nt11.62□□□□□ -0.55
SLX1P38324 AQY1YPR192W 918 nt11.62□□□□□ -0.55
SLX1P38324 BIO4YNR057C 714 nt11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms