Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 YDR095CYDR095C 411 nt15.14■□□□□ 0.01
APL2P36000 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.13■□□□□ 0.01
APL2P36000 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.13■□□□□ 0.01
APL2P36000 IMP2'YIL154C 1041 nt15.09■□□□□ 0.01
APL2P36000 YCH1YGR203W 447 nt15.05■□□□□ -0
APL2P36000 YJL152WYJL152W 360 nt15.03■□□□□ -0
APL2P36000 SIS1YNL007C 1059 nt15.02■□□□□ -0
APL2P36000 LPX1YOR084W 1164 nt14.98□□□□□ -0.01
APL2P36000 TIR4YOR009W 1464 nt14.95□□□□□ -0.02
APL2P36000 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.94□□□□□ -0.02
APL2P36000 SPP1YPL138C 1062 nt14.91□□□□□ -0.02
APL2P36000 ERV46YAL042W 1248 nt14.9□□□□□ -0.02
APL2P36000 SPT5YML010W 3192 nt14.88□□□□□ -0.03
APL2P36000 IDH1YNL037C 1083 nt14.86□□□□□ -0.03
APL2P36000 PTP1YDL230W 1008 nt14.84□□□□□ -0.03
APL2P36000 RPP2AYOL039W 321 nt14.84□□□□□ -0.03
APL2P36000 MRPL8YJL063C 717 nt14.81□□□□□ -0.04
APL2P36000 YDR433WYDR433W 441 nt14.79□□□□□ -0.04
APL2P36000 ART5YGR068C 1761 nt14.79□□□□□ -0.04
APL2P36000 MEP2YNL142W 1500 nt14.78□□□□□ -0.04
APL2P36000 YKR040CYKR040C 504 nt14.74□□□□□ -0.05
APL2P36000 MXR2YCL033C 507 nt14.74□□□□□ -0.05
APL2P36000 YMR057CYMR057C 372 nt14.73□□□□□ -0.05
APL2P36000 GBP2YCL011C 1284 nt14.73□□□□□ -0.05
APL2P36000 RTG1YOL067C 534 nt14.71□□□□□ -0.05
APL2P36000 GFD2YCL036W 1701 nt14.69□□□□□ -0.06
APL2P36000 CAC2YML102W 1407 nt14.69□□□□□ -0.06
APL2P36000 PET9YBL030C 957 nt14.68□□□□□ -0.06
APL2P36000 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.65□□□□□ -0.06
APL2P36000 YEL076CYEL076C 651 nt14.65□□□□□ -0.06
APL2P36000 YLR464WYLR464W 651 nt14.65□□□□□ -0.06
APL2P36000 DCW1YKL046C 1350 nt14.63□□□□□ -0.07
APL2P36000 ADO1YJR105W 1023 nt14.57□□□□□ -0.08
APL2P36000 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.56□□□□□ -0.08
APL2P36000 DED1YOR204W 1815 nt14.52□□□□□ -0.09
APL2P36000 UBX6YJL048C 1191 nt14.51□□□□□ -0.09
APL2P36000 FPS1YLL043W 2010 nt14.5□□□□□ -0.09
APL2P36000 TCD2YKL027W 1344 nt14.48□□□□□ -0.09
APL2P36000 RRD1YIL153W 1182 nt14.47□□□□□ -0.09
APL2P36000 RTS2YOR077W 699 nt14.47□□□□□ -0.09
APL2P36000 FRD1YEL047C 1413 nt14.43□□□□□ -0.1
APL2P36000 IRC15YPL017C 1500 nt14.42□□□□□ -0.1
APL2P36000 EMI2YDR516C 1503 nt14.41□□□□□ -0.1
APL2P36000 FMT1YBL013W 1206 nt14.37□□□□□ -0.11
APL2P36000 YDL221WYDL221W 552 nt14.32□□□□□ -0.12
APL2P36000 HUA1YGR268C 597 nt14.29□□□□□ -0.12
APL2P36000 CUE1YMR264W 612 nt14.29□□□□□ -0.12
APL2P36000 PTH1YHR189W 573 nt14.28□□□□□ -0.12
APL2P36000 GIS3YLR094C 1509 nt14.27□□□□□ -0.12
APL2P36000 SOR2YDL246C 1074 nt14.23□□□□□ -0.13
APL2P36000 SOR1YJR159W 1074 nt14.23□□□□□ -0.13
APL2P36000 YCL042WYCL042W 360 nt14.2□□□□□ -0.14
APL2P36000 YDR094WYDR094W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
APL2P36000 YKL030WYKL030W 606 nt14.14□□□□□ -0.15
APL2P36000 YMR090WYMR090W 684 nt14.13□□□□□ -0.15
APL2P36000 YLR235CYLR235C 399 nt14.11□□□□□ -0.15
APL2P36000 LCB1YMR296C 1677 nt14.1□□□□□ -0.15
APL2P36000 CWP1YKL096W 720 nt14.09□□□□□ -0.15
APL2P36000 ADH2YMR303C 1047 nt14.09□□□□□ -0.15
APL2P36000 SDH1YKL148C 1923 nt14.07□□□□□ -0.16
APL2P36000 FMP52YER004W 696 nt14.07□□□□□ -0.16
APL2P36000 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.06□□□□□ -0.16
APL2P36000 SCC4YER147C 1875 nt14.06□□□□□ -0.16
APL2P36000 SSA4YER103W 1929 nt14.05□□□□□ -0.16
APL2P36000 YIL100WYIL100W 354 nt14.05□□□□□ -0.16
APL2P36000 YBR220CYBR220C 1683 nt14.02□□□□□ -0.16
APL2P36000 PCM1YEL058W 1674 nt13.93□□□□□ -0.18
APL2P36000 DIC1YLR348C 897 nt13.91□□□□□ -0.18
APL2P36000 TIM23YNR017W 669 nt13.9□□□□□ -0.18
APL2P36000 Q0182Q0182 405 nt13.88□□□□□ -0.19
APL2P36000 SNF6YHL025W 999 nt13.86□□□□□ -0.19
APL2P36000 RNQ1YCL028W 1218 nt13.8□□□□□ -0.2
APL2P36000 YIH1YCR059C 777 nt13.79□□□□□ -0.2
APL2P36000 YLR179CYLR179C 606 nt13.79□□□□□ -0.2
APL2P36000 RRT12YCR045C 1476 nt13.79□□□□□ -0.2
APL2P36000 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.78□□□□□ -0.2
APL2P36000 PAU16YKL224C 372 nt13.78□□□□□ -0.2
APL2P36000 PRE6YOL038W 765 nt13.78□□□□□ -0.2
APL2P36000 YFR018CYFR018C 1092 nt13.77□□□□□ -0.21
APL2P36000 WSC2YNL283C 1512 nt13.75□□□□□ -0.21
APL2P36000 AHT1YHR093W 549 nt13.7□□□□□ -0.22
APL2P36000 YPR064WYPR064W 420 nt13.7□□□□□ -0.22
APL2P36000 YNL195CYNL195C 786 nt13.69□□□□□ -0.22
APL2P36000 TAD3YLR316C 969 nt13.68□□□□□ -0.22
APL2P36000 YHL050CYHL050C 2094 nt13.67□□□□□ -0.22
APL2P36000 YSC84YHR016C 1407 nt13.66□□□□□ -0.22
APL2P36000 YLL053CYLL053C 459 nt13.65□□□□□ -0.22
APL2P36000 BIO4YNR057C 714 nt13.64□□□□□ -0.23
APL2P36000 SBA1YKL117W 651 nt13.63□□□□□ -0.23
APL2P36000 RRT5YFR032C 870 nt13.6□□□□□ -0.23
APL2P36000 YFL066CYFL066C 1179 nt13.59□□□□□ -0.23
APL2P36000 FTR1YER145C 1215 nt13.57□□□□□ -0.24
APL2P36000 SIM1YIL123W 1431 nt13.56□□□□□ -0.24
APL2P36000 GAL1YBR020W 1587 nt13.54□□□□□ -0.24
APL2P36000 BDH1YAL060W 1149 nt13.52□□□□□ -0.25
APL2P36000 TRM5YHR070W 1500 nt13.5□□□□□ -0.25
APL2P36000 BDF1YLR399C 2061 nt13.49□□□□□ -0.25
APL2P36000 YSP3YOR003W 1437 nt13.49□□□□□ -0.25
APL2P36000 AQY1YPR192W 918 nt13.48□□□□□ -0.25
APL2P36000 PEX25YPL112C 1185 nt13.47□□□□□ -0.25
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