Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms