RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029165.3

1110008F13Rik-201, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene 1110008F13Rik, Length 1,045 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa58,42■■■■■ 6,94
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 NischQ80TM9 1593 aa57,4■■■■■ 6,78
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abcc8B2RUS7 1588 aa55,62■■■■■ 6,49
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abcc9P70170 1546 aa55,47■■■■■ 6,47
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 ScribQ80U72 1612 aa54,03■■■■■ 6,24
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 NacadQ5SWP3 1504 aa52,24■■■■■ 5,95
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kdm5dQ62240 1548 aa52,11■■■■■ 5,93
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Sycp2Q9CUU3 1500 aa51,23■■■■■ 5,79
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Dcaf1Q80TR8 1506 aa51,04■■■■■ 5,76
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 BicraF8VPZ9 1578 aa50,61■■■■■ 5,69
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa50,03■■■■■ 5,6
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa50,02■■■■■ 5,6
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP49,34■■■■■ 5,49
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Baz1aO88379 1555 aa49,24■■■■■ 5,47
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP49,17■■■■■ 5,46
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ccdc180J3QNE4 1664 aa49,16■■■■■ 5,46
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Crybg2B7ZCC2 1516 aa49,06■■■■■ 5,44
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rhox8Q6VSS7 320 aa49,06■■■■■ 5,44
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP48,74■■■■■ 5,39
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP48,67■■■■■ 5,38
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48,37■■■■■ 5,33
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ercc6F8VPZ5 1481 aa48,35■■■■■ 5,33
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP48,16■■■■■ 5,3
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Smarca2Q6DIC0 1577 aa48,16■■■■■ 5,3
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa47,99■■■■■ 5,27
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fam135aQ6NS59 1506 aa47,93■■■■■ 5,26
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa47,78■■■■■ 5,24
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Wdr62Q3U3T8 1523 aa47,65■■■■■ 5,22
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Frmpd1A2AKB4 1549 aa47,56■■■■■ 5,2
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP47,43■■■■■ 5,18
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Baz1bQ9Z277 1479 aa47,36■■■■■ 5,17
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ubl4bQ9CQ84 188 aa47,03■■■■■ 5,12
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Unc13aQ4KUS2 1712 aa46,96■■■■■ 5,11
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Mrc2Q64449 1479 aa46,83■■■■■ 5,09
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa46,65■■■■■ 5,06
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rtl1Q7M732 1744 aa46,61■■■■■ 5,05
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 CftrP26361 1476 aa46,61■■■■■ 5,05
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Synj1Q8CHC4 1574 aa46,48■■■■■ 5,03
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP46,37■■■■■ 5,01
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa45,99■■■■■ 4,95
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Trim41Q5NCC3 630 aa45,93■■■■■ 4,94
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa45,89■■■■■ 4,94
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Dnajc5P60904 198 aa45,88■■■■■ 4,94
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP45,83■■■■■ 4,93
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cux2P70298 1426 aa45,79■■■■■ 4,92
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP45,75■■■■■ 4,91
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kif15Q6P9L6 1387 aa45,71■■■■■ 4,91
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kif21aQ9QXL2 1672 aa45,63■■■■■ 4,9
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Lamc3Q9R0B6 1581 aa45,41■■■■■ 4,86
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP45,29■■■■■ 4,84
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45,24■■■■■ 4,83
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cep164Q5DU05 1446 aa45,1■■■■■ 4,81
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Shroom2A2ALU4 1481 aa44,95■■■■■ 4,79
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP44,83■■■■■ 4,77
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ccdc18Q640L5 1455 aa44,8■■■■■ 4,76
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP44,78■■■■■ 4,76
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Plb1Q3TTY0 1478 aa44,73■■■■■ 4,75
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 TnnQ80Z71 1560 aa44,73■■■■■ 4,75
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Il27Q8K3I6 234 aa44,71■■■■■ 4,75
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Crocc2F6XLV1 1638 aa44,63■■■■■ 4,73
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP44,59■■■■■ 4,73
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Camsap1A2AHC3 1581 aa44,56■■■■■ 4,72
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Top2bQ64511 1612 aa44,55■■■■■ 4,72
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Golga3P55937 1487 aa44,49■■■■■ 4,71
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Col17a1Q07563 1470 aa44,41■■■■■ 4,7
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP44,39■■■■■ 4,7
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cngb1E1AZ71 1325 aa44,38■■■■■ 4,69
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ift140E9PY46 1464 aa44,34■■■■■ 4,69
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rusc2Q80U22 1514 aa44,33■■■■■ 4,69
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP44,28■■■■■ 4,68
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fmn1Q05860 1466 aa44,14■■■■■ 4,66
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP44,13■■■■■ 4,66
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Duox2A2AQ99 1517 aa44,07■■■■■ 4,65
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP43,9■■■■■ 4,62
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Disp1Q3TDN0 1521 aa43,89■■■■■ 4,62
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Grin2bQ01097 1482 aa43,87■■■■■ 4,61
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP43,81■■■■■ 4,6
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Samd9lQ69Z37 1561 aa43,76■■■■■ 4,6
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Setd1bQ8CFT2 1985 aa43,74■■■■■ 4,59
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP43,72■■■■■ 4,59
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa43,71■■■■■ 4,59
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Efcab5A0JP43 1406 aa43,58■■■■■ 4,57
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rad54l2Q99NG0 1466 aa43,44■■■■■ 4,54
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Grin2aP35436 1464 aa43,4■■■■■ 4,54
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP43,39■■■■■ 4,54
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Adgrl3Q80TS3 1537 aa43,35■■■■■ 4,53
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Magi3Q9EQJ9 1476 aa43,34■■■■■ 4,53
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43,33■■■■■ 4,53
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 PtprkP35822 1457 aa43,29■■■■■ 4,52
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cep170Q6A065 1588 aa43,26■■■■■ 4,52
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa43,24■■■■■ 4,51
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa43,21■■■■■ 4,51
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 NrkQ9R0G8 1455 aa43,21■■■■■ 4,51
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa43,17■■■■■ 4,5
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP43,17■■■■■ 4,5
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa43,13■■■■■ 4,5
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 AknaQ80VW7 1404 aa43,08■■■■■ 4,49
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gm156Q58A37 223 aa43,06■■■■■ 4,48
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gpatch8A2A6A1 1505 aa43,04■■■■■ 4,48
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pla2r1Q62028 1487 aa43,02■■■■■ 4,48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,7 ms