Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms