Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP1Q9Y3L3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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