Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms