Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms