Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM35Q9UPQ4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms