Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms